Trama: Molto tempo fa, un gruppo di dieci Digimon si sacrificò per sconfiggere la minaccia più grande che avesse mai messo in pericolo Digiworld. Questi Guerrieri Leggendari crearono degli artefatti dai loro dati, i venti "Digispirit", prima di lasciare il mondo digitale nella mani dei tre Digimon Celesti. Tuttavia, uno dei tre, Kerpymon, iniziò un regno di terrore. Per contrastare questo fenomeno, il Digimon Celeste Ophanimon decide di convocare a Digiworld cinque ragazzi dal mondo umano tramite un Trailmon, Digimon dalle sembianze di un treno. Una volta lì, i cinque Digiprescelti trovano i loro rispettivi Digispirit di tipo Umano ed eseguono per la prima volta la "Digievoluzione Spirit", che permette loro di trasformarsi in Digimon, più precisamente in cinque dei dieci Guerrieri Leggendari. Tuttavia, mentre sono impegnati nella ricerca dei rispettivi Digispirit di tipo Animale, i cinque si ritrovano cacciati dagli altri cinque Guerrieri Leggendari, che sono stati corrotti dalle tenebre di Kerpymon.
Dopo la sconfitta dei primi quattro, Koji scopre che Duskmon, il quinto Guerriero Leggendario malvagio, è in realtà suo fratello gemello, Koichi Kimura. Con l'aiuto di Takuya, Koji riesce a liberare suo fratello e ripristina i Digispirit dell'Oscurità di Koichi nella loro forma originaria, permettendo al fratello di unirsi alla squadra come il Guerriero Leggendario dell'Oscurità originale, Löwemon. Dopo la sconfitta di Kerpymon, i Digiprescelti vengono a sapere che la mente di tutto non era il malvagio Digimon Celeste, bensì un Digimon fatto di pura malvagità che un tempo era stato sigillato nel cuore di Digiworld grazie ai Guerrieri Leggendari: Lucemon. Così i sei Digiprescelti devono cercare di sconfiggere i due Cavalieri Reali, emissari di Lucemon, prima che i due completino la scansione di tutto Digiworld, inviando poi i dati al loro padrone Lucemon allo scopo di completare la sua rinascita.
